本文整理汇总了Python中qiita_db.job.Job.options方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Job.options方法的具体用法?Python Job.options怎么用?Python Job.options使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类qiita_db.job.Job
的用法示例。
在下文中一共展示了Job.options方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: _build_analysis_files
# 需要导入模块: from qiita_db.job import Job [as 别名]
# 或者: from qiita_db.job.Job import options [as 别名]
def _build_analysis_files(analysis, r_depth=None, **kwargs):
"""Creates the biom tables and mapping file, then adds to jobs
Parameters
----------
analysis : Analysis object
The analysis to build files for
r_depth : int, optional
Rarefaction depth for biom table creation. Default None
"""
# create the biom tables and add jobs to the analysis
analysis.status = "running"
analysis.build_files(r_depth)
mapping_file = analysis.mapping_file
biom_tables = analysis.biom_tables
# add files to existing jobs
for job_id in analysis.jobs:
job = Job(job_id)
if job.status == 'queued':
opts = {
"--otu_table_fp": biom_tables[job.datatype],
"--mapping_fp": mapping_file
}
job_opts = job.options
job_opts.update(opts)
job.options = job_opts