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Python Solver.yobs[target][i]方法代码示例

本文整理汇总了Python中pysb.integrate.Solver.yobs[target][i]方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Solver.yobs[target][i]方法的具体用法?Python Solver.yobs[target][i]怎么用?Python Solver.yobs[target][i]使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pysb.integrate.Solver的用法示例。


在下文中一共展示了Solver.yobs[target][i]方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: run_query

# 需要导入模块: from pysb.integrate import Solver [as 别名]
# 或者: from pysb.integrate.Solver import yobs[target][i] [as 别名]
def run_query(model, query):
    m = re.match('Is the amount of (.+) ([^ ]+) in time?', query)
    target_str = m.groups()[0]
    pattern_str = m.groups()[1]

    ts = numpy.linspace(0, 100, 10)
    solver = Solver(model, ts)
    solver.run()

    if target_str == 'A-B complex':
        target = 'AB'

    if target_str == 'A':
        target = 'A'

    for i, a in enumerate(solver.yobs[target]):
        solver.yobs[target][i] = 1 if a > 50 else 0

    if pattern_str == 'sustained':
        fstr = sustained_formula(target)
    elif pattern_str == 'transient':
        fstr = transient_formula(target)
    elif pattern_str == 'unchanged':
        fstr = noact_formula(target)

    print '\n\n'
    print '-----------'
    print query
    print 'LTL formula: %s' % fstr
    mc = ModelChecker(fstr, solver.yobs)
    print solver.yobs[target]
    print 'Result:', mc.truth
    print '-----------'
开发者ID:sorgerlab,项目名称:bioagents,代码行数:35,代码来源:run_tra.py


注:本文中的pysb.integrate.Solver.yobs[target][i]方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。