本文整理汇总了Python中pymatgen.Structure.get_distance方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Structure.get_distance方法的具体用法？Python Structure.get_distance怎么用？Python Structure.get_distance使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pymatgen.Structure的用法示例。
在下文中一共展示了Structure.get_distance方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: get_midpoint
# 需要导入模块: from pymatgen import Structure [as 别名]
# 或者: from pymatgen.Structure import get_distance [as 别名]
def get_midpoint(structure : Structure, atom_1, atom_2):
a = structure.lattice.a
b = structure.lattice.b
c = structure.lattice.c
d = 999
for x in [0,1,-1]:
for y in [0,1,-1]:
for z in [0,1,-1]:
jimage = np.array([x,y,z])
temp_d = structure.get_distance(atom_1, atom_2, jimage=jimage)
if temp_d < d:
d = temp_d
coord = structure[atom_1].frac_coords + structure[atom_2].frac_coords - jimage
coord /= 2
if d < a*0.5 and d < b*0.5 and d < c*0.5:
return coord
return coord