本文整理汇总了Python中pyfaidx.Faidx.close方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Faidx.close方法的具体用法?Python Faidx.close怎么用?Python Faidx.close使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pyfaidx.Faidx
的用法示例。
在下文中一共展示了Faidx.close方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_reindex_on_modification
# 需要导入模块: from pyfaidx import Faidx [as 别名]
# 或者: from pyfaidx.Faidx import close [as 别名]
def test_reindex_on_modification(self):
""" This test ensures that the index is regenerated when the FASTA
modification time is newer than the index modification time.
mdshw5/pyfaidx#50 """
faidx = Faidx('data/genes.fasta')
index_mtime = getmtime(faidx.indexname)
faidx.close()
os.utime('data/genes.fasta', (index_mtime + 10, ) * 2)
time.sleep(2)
faidx = Faidx('data/genes.fasta')
assert getmtime(faidx.indexname) > index_mtime