本文整理汇总了Python中pyfaidx.Faidx.build_fai方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Faidx.build_fai方法的具体用法？Python Faidx.build_fai怎么用？Python Faidx.build_fai使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pyfaidx.Faidx的用法示例。
在下文中一共展示了Faidx.build_fai方法的3个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_samtools_compare
# 需要导入模块: from pyfaidx import Faidx [as 别名]
# 或者: from pyfaidx.Faidx import build_fai [as 别名]
def test_samtools_compare(self):
with open(self.samtools, 'r') as expect:
expect = expect.read()
index = Faidx.build_fai(self.fasta)
result = ''.join(index)
assert result == expect示例2: test_order
# 需要导入模块: from pyfaidx import Faidx [as 别名]
# 或者: from pyfaidx.Faidx import build_fai [as 别名]
def test_order(self):
index = Faidx.build_fai(self.fasta)
genes = [x.split()[0] for x in index]
assert genes == list(self.faidx.index.keys())示例3: test_build
# 需要导入模块: from pyfaidx import Faidx [as 别名]
# 或者: from pyfaidx.Faidx import build_fai [as 别名]
def test_build(self):
with open(self.expect, 'r') as fai:
expect = fai.read()
index = Faidx.build_fai(self.fasta)
result = ''.join(index)
assert result == expect