本文整理汇总了Python中paleomix.common.formats.msa.MSA.to_file方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python MSA.to_file方法的具体用法？Python MSA.to_file怎么用？Python MSA.to_file使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类paleomix.common.formats.msa.MSA的用法示例。
在下文中一共展示了MSA.to_file方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_msa_to_file__complete_line_test
# 需要导入模块: from paleomix.common.formats.msa import MSA [as 别名]
# 或者: from paleomix.common.formats.msa.MSA import to_file [as 别名]
def test_msa_to_file__complete_line_test():
msa = MSA([FASTA("barfoo", None, "ACGATA" * 10 + "CGATAG" * 5),
FASTA("foobar", None, "CGAATG" * 10 + "TGTCAT" * 5)])
expected = ">barfoo\n%s\n%s\n" % ("ACGATA" * 10, "CGATAG" * 5)
expected += ">foobar\n%s\n%s\n" % ("CGAATG" * 10, "TGTCAT" * 5)
stringf = StringIO.StringIO()
MSA.to_file(msa, stringf)
assert_equal(stringf.getvalue(), expected)