本文整理汇总了Python中output.Output.output_all_variants方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Output.output_all_variants方法的具体用法?Python Output.output_all_variants怎么用?Python Output.output_all_variants使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类output.Output
的用法示例。
在下文中一共展示了Output.output_all_variants方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: output
# 需要导入模块: from output import Output [as 别名]
# 或者: from output.Output import output_all_variants [as 别名]
def output(self):
# The output option handler that will write the sample_variants_csv containing important information about
# the sample variants.
if self.args['type'] == 'sample':
if self.args['name'] == "all":
output_files = Output()
output_files.output_all_variants()
else:
if not sampleinfo_mongo.is_fully_annotated(self.args['name']):
annotate = Annotate()
annotate.annotate_sample(self.args['name'], 'orig')
output_files = Output()
output_files.sample_variants_csv(self.args['name'], 'orig')