本文整理汇总了Python中msmbuilder.Trajectory.load_from_hdf方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Trajectory.load_from_hdf方法的具体用法？Python Trajectory.load_from_hdf怎么用？Python Trajectory.load_from_hdf使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类msmbuilder.Trajectory的用法示例。
在下文中一共展示了Trajectory.load_from_hdf方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: xrange
# 需要导入模块: from msmbuilder import Trajectory [as 别名]
# 或者: from msmbuilder.Trajectory import load_from_hdf [as 别名]
parser = arglib.ArgumentParser()
parser.add_argument('traj_dir', help='Directory to find trajectory files.')
parser.add_argument('conf_fn', help='Conformation filename that has the same atom names and residue IDs, etc. as the trajectories.')
parser.add_argument('output', default='./ProjectInfo.yaml', help='Output filename [ ./ProjectInfo.yaml ]')
args = parser.parse_args()
traj_list = [ os.path.join(args.traj_dir, fn) for fn in os.listdir(args.traj_dir)]
traj_list.sort(key=utils.keynat) # = list.sort(traj_list, key=utils.keynat)
print traj_list
traj_lens = []
for i in xrange(len(traj_list)):
print i
shape = Trajectory.load_from_hdf(traj_list[i], JustInspect=True)
traj_lens.append(shape[0])
records = { 'conf_filename' : args.conf_fn,
'traj_lengths' : traj_lens,
'traj_paths' : traj_list,
'traj_converted_from' : [[] for fn in traj_list],
'traj_errors' : [None for fn in traj_list]
}
project = Project(records=records)
project.save(args.output)