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Python GraphLabels.load方法代码示例

本文整理汇总了Python中khmer.GraphLabels.load方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python GraphLabels.load方法的具体用法?Python GraphLabels.load怎么用?Python GraphLabels.load使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在khmer.GraphLabels的用法示例。


在下文中一共展示了GraphLabels.load方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_get_labels_save_load

# 需要导入模块: from khmer import GraphLabels [as 别名]
# 或者: from khmer.GraphLabels import load [as 别名]
def test_get_labels_save_load():
    lb_pre = GraphLabels.NodeGraphLabels(20, 1e7, 4)
    filename = utils.get_test_data('test-labels.fa')
    lb_pre.consume_seqfile_and_tag_with_labels(filename)

    # save labels to a file
    savepath = utils.get_temp_filename('saved.labels')
    lb_pre.save_labels_and_tags(savepath)

    # trash the old GraphLabels
    del lb_pre

    # create new, load labels & tags
    graph = Nodegraph(20, 1e7, 4)
    lb = GraphLabels.load(savepath, graph)

    labels = list(lb.labels())
    expected = [0, 1, 2, 3]
    for e_label in expected:
        assert e_label in labels
    for a_label in labels:
        assert a_label in expected
开发者ID:betatim,项目名称:khmer,代码行数:24,代码来源:test_labelhash.py


注:本文中的khmer.GraphLabels.load方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。