Python GraphLabels.consume_sequence_and_tag_with_labels方法代码示例

本文整理汇总了Python中khmer.GraphLabels.consume_sequence_and_tag_with_labels方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python GraphLabels.consume_sequence_and_tag_with_labels方法的具体用法？Python GraphLabels.consume_sequence_and_tag_with_labels怎么用？Python GraphLabels.consume_sequence_and_tag_with_labels使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类khmer.GraphLabels的用法示例。

在下文中一共展示了GraphLabels.consume_sequence_and_tag_with_labels方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_consume_sequence_and_tag_with_labels

# 需要导入模块: from khmer import GraphLabels [as 别名]
# 或者: from khmer.GraphLabels import consume_sequence_and_tag_with_labels [as 别名]
def test_consume_sequence_and_tag_with_labels():
    lb = GraphLabels(20, 1e6, 4)
    label = 0
    sequence = 'ATGCATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCG'

    lb.consume_sequence_and_tag_with_labels(sequence, label)
    labels = set()
    labels.update(lb.sweep_label_neighborhood(sequence))

    assert label in labels
    assert len(labels) == 1

注：本文中的khmer.GraphLabels.consume_sequence_and_tag_with_labels方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台，相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目，源码版权归原作者所有，传播和使用请参考对应项目的License；未经允许，请勿转载。