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Python Graph.vs["psa"]方法代码示例

本文整理汇总了Python中igraph.Graph.vs["psa"]方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Graph.vs["psa"]方法的具体用法?Python Graph.vs["psa"]怎么用?Python Graph.vs["psa"]使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在igraph.Graph的用法示例。


在下文中一共展示了Graph.vs["psa"]方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: check_edge

# 需要导入模块: from igraph import Graph [as 别名]
# 或者: from igraph.Graph import vs["psa"] [as 别名]
    cand = check_edge(sm, current, root)
    if cand:
        logging.debug("connect {} and {}".format(cand, root))
        edges.append((cand, root))
        current.remove(cand)
        sm[:, cand] = 0

    remain.remove(root)
    sm[:, root] = 0

    for i in np.where(sm[root] > threshold)[0].tolist():
        if i in remain:
            edges.append((root, i))
            sim_edges.append(sm[root, i])
            new.add(i)

    logging.debug("new nodes: {}".format(new))
    current |= new
    remain -= current
    new = set()

g = Graph(edges)
g.vs["smiles"] = smiles
g.vs["activities"] = acts
g.vs["psa"] = psas
g.vs["alogp"] = alogps
g.es["similarity"] = sim_edges
g.save("test.gml")

print g.evcent()
开发者ID:kzfm,项目名称:mishimasyk4,代码行数:32,代码来源:dt.py


注:本文中的igraph.Graph.vs["psa"]方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。