本文整理汇总了Python中ete3.TreeStyle.root_opening_factor方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TreeStyle.root_opening_factor方法的具体用法?Python TreeStyle.root_opening_factor怎么用?Python TreeStyle.root_opening_factor使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ete3.TreeStyle
的用法示例。
在下文中一共展示了TreeStyle.root_opening_factor方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: get_example_tree
# 需要导入模块: from ete3 import TreeStyle [as 别名]
# 或者: from ete3.TreeStyle import root_opening_factor [as 别名]
def get_example_tree():
# Set dashed blue lines in all leaves
nst1 = NodeStyle()
nst1["bgcolor"] = "LightSteelBlue"
nst2 = NodeStyle()
nst2["bgcolor"] = "Moccasin"
nst3 = NodeStyle()
nst3["bgcolor"] = "DarkSeaGreen"
nst4 = NodeStyle()
nst4["bgcolor"] = "Khaki"
t = Tree("((((a1,a2),a3), ((b1,b2),(b3,b4))), ((c1,c2),c3));")
for n in t.traverse():
n.dist = 0
n1 = t.get_common_ancestor("a1", "a2", "a3")
n1.set_style(nst1)
n2 = t.get_common_ancestor("b1", "b2", "b3", "b4")
n2.set_style(nst2)
n3 = t.get_common_ancestor("c1", "c2", "c3")
n3.set_style(nst3)
n4 = t.get_common_ancestor("b3", "b4")
n4.set_style(nst4)
ts = TreeStyle()
ts.layout_fn = layout
ts.show_leaf_name = False
ts.mode = "c"
ts.root_opening_factor = 1
return t, ts