本文整理汇总了Python中cogent.core.profile.Profile.normalizeSequences方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Profile.normalizeSequences方法的具体用法？Python Profile.normalizeSequences怎么用？Python Profile.normalizeSequences使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类cogent.core.profile.Profile的用法示例。
在下文中一共展示了Profile.normalizeSequences方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_normalizeSequences
# 需要导入模块: from cogent.core.profile import Profile [as 别名]
# 或者: from cogent.core.profile.Profile import normalizeSequences [as 别名]
def test_normalizeSequences(self):
"""normalizeSequences: should normalize or raise appropriate error
"""
p = self.full.copy()
p.normalizeSequences()
self.assertEqual(p.Data, array([[2 / 9, 4 / 17], [3 / 9, 5 / 17], [4 / 9, 8 / 17]]))
self.assertEqual(sum(p.Data, axis=0), [1, 1])
p = self.empty_row.copy()
p.normalizeSequences()
self.assertEqual(p.Data, array([[1, 1], [0, 0]]))
p = self.empty_col.copy()
self.assertRaises(ProfileError, p.normalizeSequences)
p = Profile(array([[0.0], [0.0]]), "AB")
self.assertRaises(ProfileError, p.normalizeSequences)
# negative numbers!!!!!!
p1 = Profile(array([[3, 4], [-2, -3]]), "AB")
p1.normalizeSequences()
self.assertEqual(p1.Data, array([[3, 4], [-2, -3]]))
p2 = Profile(array([[3, 4], [-3, -3]]), "AB")
self.assertRaises(ProfileError, p2.normalizeSequences)