本文整理汇总了Python中cogent.core.profile.Profile.distance方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Profile.distance方法的具体用法?Python Profile.distance怎么用?Python Profile.distance使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类cogent.core.profile.Profile
的用法示例。
在下文中一共展示了Profile.distance方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_distance
# 需要导入模块: from cogent.core.profile import Profile [as 别名]
# 或者: from cogent.core.profile.Profile import distance [as 别名]
def test_distance(self):
"""distance: should return correct distance between the profiles
"""
p1 = Profile(array([[2, 4], [3, 1]]), "AB")
p2 = Profile(array([[4, 6], [5, 3]]), "AB")
p3 = Profile(array([[4, 6], [5, 3], [1, 1]]), "AB")
p4 = Profile(array([2, 2]), "AB")
p5 = Profile(array([2, 2, 2]), "AB")
p6 = Profile(array([[]]), "AB")
self.assertEqual(p1.distance(p2), 4)
self.assertEqual(p2.distance(p1), 4)
self.assertEqual(p1.distance(p4), sqrt(6))
self.assertEqual(p6.distance(p6), 0)
# Raises error when frames are not aligned
self.assertRaises(ProfileError, p1.distance, p3)
self.assertRaises(ProfileError, p1.distance, p5)