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Python Profile.distance方法代码示例

本文整理汇总了Python中cogent.core.profile.Profile.distance方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Profile.distance方法的具体用法?Python Profile.distance怎么用?Python Profile.distance使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在cogent.core.profile.Profile的用法示例。


在下文中一共展示了Profile.distance方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_distance

# 需要导入模块: from cogent.core.profile import Profile [as 别名]
# 或者: from cogent.core.profile.Profile import distance [as 别名]
    def test_distance(self):
        """distance: should return correct distance between the profiles
        """
        p1 = Profile(array([[2, 4], [3, 1]]), "AB")
        p2 = Profile(array([[4, 6], [5, 3]]), "AB")
        p3 = Profile(array([[4, 6], [5, 3], [1, 1]]), "AB")
        p4 = Profile(array([2, 2]), "AB")
        p5 = Profile(array([2, 2, 2]), "AB")
        p6 = Profile(array([[]]), "AB")

        self.assertEqual(p1.distance(p2), 4)
        self.assertEqual(p2.distance(p1), 4)
        self.assertEqual(p1.distance(p4), sqrt(6))
        self.assertEqual(p6.distance(p6), 0)

        # Raises error when frames are not aligned
        self.assertRaises(ProfileError, p1.distance, p3)
        self.assertRaises(ProfileError, p1.distance, p5)
开发者ID:blankenberg,项目名称:pycogent,代码行数:20,代码来源:test_profile.py


注:本文中的cogent.core.profile.Profile.distance方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。