本文整理汇总了Python中cogent.LoadTree.sameTopology方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python LoadTree.sameTopology方法的具体用法？Python LoadTree.sameTopology怎么用？Python LoadTree.sameTopology使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类cogent.LoadTree的用法示例。
在下文中一共展示了LoadTree.sameTopology方法的2个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_sameShape
# 需要导入模块: from cogent import LoadTree [as 别名]
# 或者: from cogent.LoadTree import sameTopology [as 别名]
def test_sameShape(self):
"""test topology assessment"""
t1 = LoadTree(treestring="(((s1,s5),s3),s2,s4);")
t2 = LoadTree(treestring="((s1,s5),(s2,s4),s3);")
t3 = LoadTree(treestring="((s1,s4),(s2,s5),s3);")
assert t1.sameTopology(t2), (t1, t2)
assert not t1.sameTopology(t3), (t1, t3)
assert not t2.sameTopology(t3), (t2, t3)示例2: test_get_tree_get_splits
# 需要导入模块: from cogent import LoadTree [as 别名]
# 或者: from cogent.LoadTree import sameTopology [as 别名]
def test_get_tree_get_splits(self):
"""getTree should provide a reciprocal map of getSplits"""
tree = LoadTree(filename=os.path.join(data_path,"murphy.tree"))
self.assertTrue(tree.sameTopology(getTree(getSplits(tree))))