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Python ADAMContext.loadCoverage方法代码示例

本文整理汇总了Python中bdgenomics.adam.adamContext.ADAMContext.loadCoverage方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python ADAMContext.loadCoverage方法的具体用法?Python ADAMContext.loadCoverage怎么用?Python ADAMContext.loadCoverage使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在bdgenomics.adam.adamContext.ADAMContext的用法示例。


在下文中一共展示了ADAMContext.loadCoverage方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_load_coverage

# 需要导入模块: from bdgenomics.adam.adamContext import ADAMContext [as 别名]
# 或者: from bdgenomics.adam.adamContext.ADAMContext import loadCoverage [as 别名]
    def test_load_coverage(self):


        testFile = self.resourceFile("sample_coverage.bed")
        ac = ADAMContext(self.ss)

        coverage = ac.loadCoverage(testFile)

        self.assertEqual(coverage.toDF().count(), 3)
开发者ID:bigdatagenomics,项目名称:adam,代码行数:11,代码来源:adamContext_test.py


注:本文中的bdgenomics.adam.adamContext.ADAMContext.loadCoverage方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。