本文整理汇总了Python中autoprotocol.protocol.Protocol.illuminaseq方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Protocol.illuminaseq方法的具体用法？Python Protocol.illuminaseq怎么用？Python Protocol.illuminaseq使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类autoprotocol.protocol.Protocol的用法示例。
在下文中一共展示了Protocol.illuminaseq方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_illumina
# 需要导入模块: from autoprotocol.protocol import Protocol [as 别名]
# 或者: from autoprotocol.protocol.Protocol import illuminaseq [as 别名]
def test_illumina(self):
"""
Desired Output:
1. Illumina sequence wells test_plate6/0, test_plate6/1 with library size 34
"""
p = Protocol()
sample_wells6 = p.ref(
"test_plate6", None, "96-pcr", discard=True).wells_from(0, 8)
p.illuminaseq("PE", [{"object": sample_wells6[0], "library_concentration": 1.0},
{"object": sample_wells6[1], "library_concentration": 2}],
"nextseq", "mid", 'none', 34, "dataref")
pjsonString = json.dumps(p.as_dict(), indent=2)
pjson = json.loads(pjsonString)
parser_instance = english.AutoprotocolParser(pjson)
parser_instance.job_tree()
parsed_output = parser_instance.parsed_output
steps = parser_instance.object_list
forest = parser_instance.forest_list
self.assertEqual(
parsed_output, ["Illumina sequence wells test_plate6/0, test_plate6/1 with library size 34"])
self.assertEqual(forest, [[1]])