本文整理汇总了Python中ase.optimize.QuasiNewton.replay_trajectory方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python QuasiNewton.replay_trajectory方法的具体用法？Python QuasiNewton.replay_trajectory怎么用？Python QuasiNewton.replay_trajectory使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ase.optimize.QuasiNewton的用法示例。
在下文中一共展示了QuasiNewton.replay_trajectory方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: a
# 需要导入模块: from ase.optimize import QuasiNewton [as 别名]
# 或者: from ase.optimize.QuasiNewton import replay_trajectory [as 别名]
from ase.io import read
from ase.vibrations import Vibrations
# Distance between Cu atoms on a (100) surface:
d = 3.6 / sqrt(2)
a = Atoms('Cu',
positions=[(0, 0, 0)],
cell=(d, d, 1.0),
pbc=(True, True, False))
a *= (2, 2, 1) # 2x2 (100) surface-cell
# Approximate height of Ag atom on Cu(100) surfece:
h0 = 2.0
a += Atom('Ag', (d / 2, d / 2, h0))
if 0:
view(a)
constraint = FixAtoms(range(len(a) - 1))
a.set_calculator(EMT())
a.set_constraint(constraint)
dyn1 = QuasiNewton(a, trajectory='AgCu1.traj', logfile='AgCu1.log')
dyn1.run(fmax=0.1)
a = read('AgCu1.traj')
a.set_calculator(EMT())
print a.constraints
dyn2 = QuasiNewton(a, trajectory='AgCu2.traj', logfile='AgCu2.log')
dyn2.replay_trajectory('AgCu1.traj')
dyn2.run(fmax=0.01)