本文整理汇总了Python中ParmedTools.ParmedActions.addcoarsegrain方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python ParmedActions.addcoarsegrain方法的具体用法？Python ParmedActions.addcoarsegrain怎么用？Python ParmedActions.addcoarsegrain使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ParmedTools.ParmedActions的用法示例。
在下文中一共展示了ParmedActions.addcoarsegrain方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: addcoarsegrain
# 需要导入模块: from ParmedTools import ParmedActions [as 别名]
# 或者: from ParmedTools.ParmedActions import addcoarsegrain [as 别名]
def addcoarsegrain(root, amber_prmtop, messages):
""" Adds coarse graining to topology file via Lula's algo """
# This implementation doesn't exist anywhere yet, so disable it
showerror('Warning', 'This functionality is not implemented in Amber yet!')
return
# We need a file
fname = file_chooser('Coarse Grain Parameter',
[('Coarse Grain Parameters', '*.cgparm'),
('All Files', '*')])
if not fname: return
try:
action = ParmedActions.addcoarsegrain(amber_prmtop, ArgumentList(fname))
messages.write('%s\n' % action)
action.execute()
except Exception, err:
showerror('Unexpected Error!', '%s: %s' % (type(err).__name__, err))
return