本文整理汇总了Python中Bio.AlignIO.MafIO.MafIndex._region2bin方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python MafIndex._region2bin方法的具体用法?Python MafIndex._region2bin怎么用?Python MafIndex._region2bin使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Bio.AlignIO.MafIO.MafIndex
的用法示例。
在下文中一共展示了MafIndex._region2bin方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_region2bin
# 需要导入模块: from Bio.AlignIO.MafIO import MafIndex [as 别名]
# 或者: from Bio.AlignIO.MafIO.MafIndex import _region2bin [as 别名]
def test_region2bin(self):
data = [(25079603, 25079787, set([0, 1, 11, 96, 776])),
(25128173, 25128248, set([0, 1, 11, 96, 776])),
(50312474, 50312703, set([0, 1, 968, 14, 120])),
(41905591, 41906101, set([0, 1, 904, 13, 112])),
(16670899, 16673060, set([0, 1, 10, 712, 88])),
(75495356, 75495494, set([0, 1, 2, 1160, 144, 17])),
(92259501, 92261053, set([0, 1, 2, 1288, 160, 19])),
(83834063, 83838132, set([0, 1, 2, 1224, 18, 152])),
(7309597, 7310411, set([0, 1, 640, 79, 9])),
(6190410, 6190999, set([0, 1, 632, 78, 9]))]
for x, y, z in data:
self.assertEqual(MafIndex._region2bin(x, y), z)
for x, y, z in data:
self.assertRaises(TypeError, MafIndex._region2bin, str(x), str(y))