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Python General.store_Residues方法代码示例

本文整理汇总了Python中General.store_Residues方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python General.store_Residues方法的具体用法?Python General.store_Residues怎么用?Python General.store_Residues使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在General的用法示例。


在下文中一共展示了General.store_Residues方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: Btn_StartGetCleft_Clicked

# 需要导入模块: import General [as 别名]
# 或者: from General import store_Residues [as 别名]
    def Btn_StartGetCleft_Clicked(self):

        if self.top.ValidateProcessRunning():
            return
            
        if self.Validate_Fields():
            self.DisplayMessage("  ERROR: Not all fields are validated.", 2)
            return
        
        try:
            TmpFile = os.path.join(self.top.GetCleftProject_Dir,'tmp.pdb')

            if self.PyMOL:
                if cmd.count_atoms(self.defaultOption.get()) == 0:
                    self.DisplayMessage("  ERROR: No atoms found for object/selection '" + self.defaultOption.get() + "'", 2)
                    return
                
                cmd.save(TmpFile, self.defaultOption.get(), 1)

        except:
            self.DisplayMessage("  ERROR: Could not save the object/selection '" + self.defaultOption.get() + "'", 2)
            return


        if self.ResiduValue.get() != '':
            
            # with HETATM groups
            if General.store_Residues(self.listResidues, TmpFile, 1) == -1:
                self.DisplayMessage("  ERROR: Could not retrieve list of residues for object/selection '" + self.defaultOption.get() + "'", 2)
                return            
            
            if self.listResidues.count(self.ResiduValue.get()) == 0:
                self.DisplayMessage("  ERROR: The residue entered could not be found in the object/selection '" + self.defaultOption.get() + "'", 2)
                self.EntryResidu.config(bg=self.top.Color_Red)
                return

            self.EntryResidu.config(bg=self.top.Color_White)

        self.DisplayMessage("  Analyzing clefts for object/selection '" + self.defaultOption.get() + "'...", 0)
        
        #TmpFile = '/Users/francisgaudreault/1stp.pdb'
        Command_Line = '"' + self.top.GetCleftExecutable + '" -p "' + TmpFile + '"' + self.Get_Arguments()
        
        # Clear temporary clefts
        self.Btn_Clear_Clicked()

        self.top.ProcessError = False
        self.top.ProcessRunning = True

        self.GetCleftRunning(True)
        
        # Run GetCleft
        StartRun = Start(self, self.queue, Command_Line)
开发者ID:NRGlab,项目名称:NRGsuite,代码行数:55,代码来源:Default.py


注:本文中的General.store_Residues方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。