本文整理汇总了Python中General.selfbin方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python General.selfbin方法的具体用法？Python General.selfbin怎么用？Python General.selfbin使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类General的用法示例。
在下文中一共展示了General.selfbin方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: int
# 需要导入模块: import General [as 别名]
# 或者: from General import selfbin [as 别名]
import os, sys, argparse, glob
import General, PDB
selfbin = General.selfbin(sys.argv[0])
par = argparse.ArgumentParser()
par.add_argument('--head', required = True, help = 'head of files')
par.add_argument('--id', default = '0.4', help = 'identity cutoff')
par.add_argument('--db', help = 'database, if not specified, use default')
par.add_argument('--conR', action = 'store_true', help = 'whether this is for a pair of contact')
par.add_argument('--env', help = 'if not None, also modify an .env file')
args = par.parse_args()
dirs = [x for x in os.listdir('.') if os.path.isdir(x)]
dirs.sort()
odir = os.getcwd()
for d in dirs:
os.chdir(odir)
os.chdir(d)
pdbs = glob.glob('*.pdb')
cmds = []
resn = int(d.split('_')[1][2:])
for pdb in pdbs:
matchf = args.head + '_' + General.changeExt(pdb, 'match')
if not os.path.isfile(matchf):
continue
pos = PDB.findPositionInPDB(pdb, resn)
# if output file is already there, skip the job
if os.path.isfile('nr'+args.id +'_'+matchf):
continue