本文整理汇总了Python中FileIO.read_fasta方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python FileIO.read_fasta方法的具体用法？Python FileIO.read_fasta怎么用？Python FileIO.read_fasta使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类FileIO的用法示例。
在下文中一共展示了FileIO.read_fasta方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: load_fasta_background
# 需要导入模块: import FileIO [as 别名]
# 或者: from FileIO import read_fasta [as 别名]
def load_fasta_background(filename, center='.'):
fasta_list = FileIO.read_fasta(filename);
result = fasta_to_chunks(fasta_list);
if(center != '.'):
result = filter_chunks(result, center);
result = result[0:300000]; #Concatenate because I don't have enough ram
formA = DataManipulation.list_to_formA(result);
return dict([('seq',result),
('formA',formA)]);