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Python FUNC.cos_angle方法代码示例

本文整理汇总了Python中FUNC.cos_angle方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python FUNC.cos_angle方法的具体用法?Python FUNC.cos_angle怎么用?Python FUNC.cos_angle使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在FUNC的用法示例。


在下文中一共展示了FUNC.cos_angle方法的3个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: pdbBoxString

# 需要导入模块: import FUNC [as 别名]
# 或者: from FUNC import cos_angle [as 别名]
def pdbBoxString(box):
    # Box vectors
    u, v, w  = box[0:3], box[3:6], box[6:9]

    # Box vector lengths
    nu, nv, nw = [math.sqrt(FUNC.norm2(i)) for i in (u, v, w)]

    # Box vector angles
    alpha = nv*nw == 0 and 90 or math.acos(FUNC.cos_angle(v, w))/d2r
    beta  = nu*nw == 0 and 90 or math.acos(FUNC.cos_angle(u, w))/d2r
    gamma = nu*nv == 0 and 90 or math.acos(FUNC.cos_angle(u, v))/d2r

    return pdbBoxLine % (10*FUNC.norm(u), 10*FUNC.norm(v), 10*FUNC.norm(w), alpha, beta, gamma)
开发者ID:Djurredejong,项目名称:martinize.py,代码行数:15,代码来源:IO.py

示例2: bbGetAngle

# 需要导入模块: import FUNC [as 别名]
# 或者: from FUNC import cos_angle [as 别名]
    def bbGetAngle(self, r, ca, ss):
        import FUNC, IO
        import math

        # Elnedyn takes angles from structure, with fc=40
        return (
            math.acos(FUNC.cos_angle([i - j for i, j in zip(ca[0], ca[1])], [i - j for i, j in zip(ca[2], ca[1])]))
            / IO.d2r,
            40,
        )
开发者ID:Djurredejong,项目名称:martinize.py,代码行数:12,代码来源:elnedyn_BBconstr_ff.py

示例3: bbGetAngle

# 需要导入模块: import FUNC [as 别名]
# 或者: from FUNC import cos_angle [as 别名]
 def bbGetAngle(self,r,ca,ss):
     # Check is it DNA residue
     if r[0] in MAP.dnares3:
         return ca in self.dnaBbAngleDictC.keys() and self.dnaBbAngleDictC[ca] or None
     # RNA is not implemented properly yet
     elif r[0] in MAP.rnares3:
         return ca in self.rnaBbAngleDictC.keys() and self.rnaBbAngleDictC[ca] or None
     # For protein
     else:
         import FUNC,IO 
         import math
         # Elnedyn takes angles from structure, with fc=40
         return (math.acos(FUNC.cos_angle([i-j for i,j in zip(ca[0],ca[1])],[i-j for i,j in zip(ca[2],ca[1])]))/IO.d2r, 40)
开发者ID:cgmartini,项目名称:martinize-dna,代码行数:15,代码来源:elnedyn22dna.py


注:本文中的FUNC.cos_angle方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。