本文整理汇总了Java中org.sbml.jsbml.Model.createCompartment方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Java Model.createCompartment方法的具体用法?Java Model.createCompartment怎么用?Java Model.createCompartment使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类org.sbml.jsbml.Model
的用法示例。
在下文中一共展示了Model.createCompartment方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Java代码示例。
示例1: createSBMLDocument
import org.sbml.jsbml.Model; //导入方法依赖的package包/类
public void createSBMLDocument(String modelId,boolean grid,boolean lema) {
sbml = new SBMLDocument(GlobalConstants.SBML_LEVEL, GlobalConstants.SBML_VERSION);
modelId = modelId.replaceAll("[\\W]|_", "_");
if (Character.isDigit(modelId.charAt(0))) modelId = "m" + modelId;
Model m = sbml.createModel(modelId);
metaIDIndex = SBMLutilities.setDefaultMetaID(sbml, m, metaIDIndex);
sbmlFile = modelId + ".xml";
createCompPlugin();
createLayoutPlugin();
createFBCPlugin();
if (!lema) {
Compartment c = m.createCompartment();
if (grid) {
if (!modelId.equals("Grid")) {
c.setId("Grid");
} else {
c.setId("GridComp");
}
loadDefaultParameters();
} else {
if (!modelId.equals("Cell")) {
c.setId("Cell");
} else {
c.setId("CellComp");
}
Port port = sbmlCompModel.createPort();
port.setId(GlobalConstants.COMPARTMENT+"__"+c.getId());
port.setIdRef(c.getId());
}
c.setSize(1);
c.setSpatialDimensions(3);
c.setConstant(true);
}
}