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Java Model.createCompartment方法代码示例

本文整理汇总了Java中org.sbml.jsbml.Model.createCompartment方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Java Model.createCompartment方法的具体用法?Java Model.createCompartment怎么用?Java Model.createCompartment使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在org.sbml.jsbml.Model的用法示例。


在下文中一共展示了Model.createCompartment方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Java代码示例。

示例1: createSBMLDocument

import org.sbml.jsbml.Model; //导入方法依赖的package包/类
public void createSBMLDocument(String modelId,boolean grid,boolean lema) {
	sbml = new SBMLDocument(GlobalConstants.SBML_LEVEL, GlobalConstants.SBML_VERSION);
	modelId = modelId.replaceAll("[\\W]|_", "_");
	if (Character.isDigit(modelId.charAt(0))) modelId = "m" + modelId;
	Model m = sbml.createModel(modelId);
	metaIDIndex = SBMLutilities.setDefaultMetaID(sbml, m, metaIDIndex); 
	sbmlFile = modelId + ".xml";
	createCompPlugin();
	createLayoutPlugin();
	createFBCPlugin();
	if (!lema) {
		Compartment c = m.createCompartment();
		if (grid) {
			if (!modelId.equals("Grid")) {
				c.setId("Grid");
			} else {
				c.setId("GridComp");
			}
			loadDefaultParameters();
		} else {
			if (!modelId.equals("Cell")) {
				c.setId("Cell");
			} else {
				c.setId("CellComp");
			}
			Port port = sbmlCompModel.createPort();
			port.setId(GlobalConstants.COMPARTMENT+"__"+c.getId());
			port.setIdRef(c.getId());
		}
		c.setSize(1);
		c.setSpatialDimensions(3);
		c.setConstant(true);
	}
}
 
开发者ID:MyersResearchGroup,项目名称:iBioSim,代码行数:35,代码来源:BioModel.java


注:本文中的org.sbml.jsbml.Model.createCompartment方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。