当前位置: 首页>>代码示例>>C++>>正文


C++ Topology::StartNewMol方法代码示例

本文整理汇总了C++中Topology::StartNewMol方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Topology::StartNewMol方法的具体用法?C++ Topology::StartNewMol怎么用?C++ Topology::StartNewMol使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Topology的用法示例。


在下文中一共展示了Topology::StartNewMol方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: ReadParm

int Parm_PDB::ReadParm(std::string const& fname, Topology &TopIn) {
  PDBfile infile;
  double XYZ[3];
  int current_res = 0;
  int last_res = -1;
  if (infile.OpenRead(fname)) return 1;
  // Loop over PDB records 
  while ( infile.NextLine() != 0 ) {
    if (infile.IsPDBatomKeyword()) {
      // If this is an ATOM / HETATM keyword, add to topology
      infile.pdb_XYZ(XYZ);
      NameType pdbresname = infile.pdb_Residue( current_res );
      TopIn.AddTopAtom(infile.pdb_Atom(), pdbresname, current_res, last_res, XYZ);
    } else if (infile.IsPDB_TER() || infile.IsPDB_END()) {
      // Indicate end of molecule for TER/END. Finish if END.
      TopIn.StartNewMol();
      if (infile.IsPDB_END()) break;
    }
  }
  // If Topology name not set with TITLE etc, use base filename.
  // TODO: Read in title.
  std::string pdbtitle;
  TopIn.SetParmName( pdbtitle, infile.Filename().Base() );

  infile.CloseFile();
  return 0;
}
开发者ID:zhangxiaoyu11,项目名称:mAMBER,代码行数:27,代码来源:Parm_PDB.cpp


注:本文中的Topology::StartNewMol方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。