本文整理汇总了C++中Topology::StartNewMol方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Topology::StartNewMol方法的具体用法?C++ Topology::StartNewMol怎么用?C++ Topology::StartNewMol使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Topology
的用法示例。
在下文中一共展示了Topology::StartNewMol方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: ReadParm
int Parm_PDB::ReadParm(std::string const& fname, Topology &TopIn) {
PDBfile infile;
double XYZ[3];
int current_res = 0;
int last_res = -1;
if (infile.OpenRead(fname)) return 1;
// Loop over PDB records
while ( infile.NextLine() != 0 ) {
if (infile.IsPDBatomKeyword()) {
// If this is an ATOM / HETATM keyword, add to topology
infile.pdb_XYZ(XYZ);
NameType pdbresname = infile.pdb_Residue( current_res );
TopIn.AddTopAtom(infile.pdb_Atom(), pdbresname, current_res, last_res, XYZ);
} else if (infile.IsPDB_TER() || infile.IsPDB_END()) {
// Indicate end of molecule for TER/END. Finish if END.
TopIn.StartNewMol();
if (infile.IsPDB_END()) break;
}
}
// If Topology name not set with TITLE etc, use base filename.
// TODO: Read in title.
std::string pdbtitle;
TopIn.SetParmName( pdbtitle, infile.Filename().Base() );
infile.CloseFile();
return 0;
}