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C++ Topology::PrintAtomInfo方法代码示例

本文整理汇总了C++中Topology::PrintAtomInfo方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Topology::PrintAtomInfo方法的具体用法?C++ Topology::PrintAtomInfo怎么用?C++ Topology::PrintAtomInfo使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Topology的用法示例。


在下文中一共展示了Topology::PrintAtomInfo方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: ProcessMask

/** Process a mask from the command line. */
int Cpptraj::ProcessMask( Sarray const& topFiles, Sarray const& refFiles,
                          std::string const& maskexpr,
                          bool verbose, bool residue ) const
{
  SetWorldSilent(true);
  if (topFiles.empty()) {
    mprinterr("Error: No topology file specified.\n");
    return 1;
  }
  ParmFile pfile;
  Topology parm;
  if (pfile.ReadTopology(parm, topFiles[0], State_.Debug())) return 1;
  if (!refFiles.empty()) {
    DataSet_Coords_REF refCoords;
    if (refCoords.LoadRefFromFile( refFiles[0], parm, State_.Debug())) return 1;
    parm.SetDistMaskRef( refCoords.RefFrame() );
  }
  if (!verbose) {
    AtomMask tempMask( maskexpr );
    if (parm.SetupIntegerMask( tempMask )) return 1;
    loudPrintf("Selected=");
    if (residue) {
      int res = -1;
      for (AtomMask::const_iterator atom = tempMask.begin(); 
                                    atom != tempMask.end(); ++atom)
      {
        if (parm[*atom].ResNum() > res) {
          loudPrintf(" %i", parm[*atom].ResNum()+1);
          res = parm[*atom].ResNum();
        }
      }
    } else
      for (AtomMask::const_iterator atom = tempMask.begin();
                                    atom != tempMask.end(); ++atom)
        loudPrintf(" %i", *atom + 1);
    loudPrintf("\n");
  } else {
    if (residue)
      parm.PrintResidueInfo( maskexpr );
    else
      parm.PrintAtomInfo( maskexpr );
  }
  return 0;
}
开发者ID:jcr13,项目名称:cpptraj,代码行数:45,代码来源:Cpptraj.cpp


注:本文中的Topology::PrintAtomInfo方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。