本文整理汇总了C++中SuffixArray::getSize方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ SuffixArray::getSize方法的具体用法？C++ SuffixArray::getSize怎么用？C++ SuffixArray::getSize使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类SuffixArray的用法示例。
在下文中一共展示了SuffixArray::getSize方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: validate
// Validate the sampled suffix array values are correct
void SampledSuffixArray::validate(const std::string filename, const BWT* pBWT)
{
ReadTable* pRT = new ReadTable(filename);
SuffixArray* pSA = new SuffixArray(pRT, 1);
std::cout << "Validating sampled suffix array entries\n";
for(size_t i = 0; i < pSA->getSize(); ++i)
{
SAElem calc = calcSA(i, pBWT);
SAElem real = pSA->get(i);
if(calc.getID() != real.getID() || calc.getPos() != real.getPos())
{
std::cout << "Error SA elements do not match for " << i << "\n";
std::cout << "Calc: " << calc << "\n";
std::cout << "Real: " << real << "\n";
exit(1);
}
}
std::cout << "All calculate SA values are correct\n";
delete pRT;
delete pSA;
}