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C++ SuffixArray::equal_range方法代码示例

本文整理汇总了C++中SuffixArray::equal_range方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ SuffixArray::equal_range方法的具体用法?C++ SuffixArray::equal_range怎么用?C++ SuffixArray::equal_range使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在SuffixArray的用法示例。


在下文中一共展示了SuffixArray::equal_range方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: addOverlapsSA

/** Add the overlaps of vseq to the graph. */
static void addOverlapsSA(Graph& g, const SuffixArray& sa,
		ContigNode v, const string& vseq)
{
	assert(!vseq.empty());
	set<ContigNode> seen;
	typedef SuffixArray::const_iterator It;
	for (string q(vseq, 0, vseq.size() - 1);
			q.size() >= opt::minOverlap; chop(q)) {
		pair<It, It> range = sa.equal_range(q);
		for (It it = range.first; it != range.second; ++it) {
			ContigNode u(it->second);
			if (seen.insert(u).second) {
				// Add the longest overlap between two vertices.
				unsigned overlap = it->first.size();
				add_edge(u, v, -overlap, static_cast<DG&>(g));
			}
		}
	}
}
开发者ID:genome-vendor,项目名称:abyss,代码行数:20,代码来源:AdjList.cpp


注:本文中的SuffixArray::equal_range方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。