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C++ Seq::FromString方法代码示例

本文整理汇总了C++中Seq::FromString方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Seq::FromString方法的具体用法?C++ Seq::FromString怎么用?C++ Seq::FromString使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Seq的用法示例。


在下文中一共展示了Seq::FromString方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: convertMAlignment2SecVect

void convertMAlignment2SecVect(SeqVect& sv, const MultipleSequenceAlignment& ma, bool fixAlpha) {
    sv.Clear();

    MuscleContext *ctx = getMuscleContext();
    ctx->fillUidsVectors(ma->getNumRows());

    unsigned i=0;
    unsigned seq_count = 0;
    foreach(const MultipleSequenceAlignmentRow& row, ma->getMsaRows()) {
        Seq *ptrSeq = new Seq();
        QByteArray name =  row->getName().toLocal8Bit();
        ptrSeq->FromString(row->getCore().constData(), name.constData());
        //stripping gaps, original Seq::StripGaps fails on MSVC9
        Seq::iterator newEnd = std::remove(ptrSeq->begin(), ptrSeq->end(), U2Msa::GAP_CHAR);
        ptrSeq->erase(newEnd, ptrSeq->end());
        if (ptrSeq->Length()!=0) {
            ctx->tmp_uIds[seq_count] = ctx->input_uIds[i];
            sv.push_back(ptrSeq);
            seq_count++; 
        }
        i++;
    }
    if (fixAlpha) {
        sv.FixAlpha();
    }
}
开发者ID:ggrekhov,项目名称:ugene,代码行数:26,代码来源:MuscleUtils.cpp


注:本文中的Seq::FromString方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。