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C++ SamRecord::getIntegerTag方法代码示例

本文整理汇总了C++中SamRecord::getIntegerTag方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ SamRecord::getIntegerTag方法的具体用法?C++ SamRecord::getIntegerTag怎么用?C++ SamRecord::getIntegerTag使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在SamRecord的用法示例。


在下文中一共展示了SamRecord::getIntegerTag方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: updateCigar

bool Revert::updateCigar(SamRecord& samRecord)
{
    // Get the OC tag, which is a string.
    const String* oldCigar = samRecord.getStringTag(SamTags::ORIG_CIGAR_TAG);
    // Get the OP tag, which is an integer.
    int* oldPos = samRecord.getIntegerTag(SamTags::ORIG_POS_TAG);

    bool status = true;
    if(oldCigar != NULL)
    {
        // The old cigar was found, so set it in the record.
        status &= samRecord.setCigar((*oldCigar).c_str());

        if(!myKeepTags)
        {
            // Remove the tag.
            status &= samRecord.rmTag(SamTags::ORIG_CIGAR_TAG, SamTags::ORIG_CIGAR_TAG_TYPE);
        }
    }
    if(oldPos != NULL)
    {
        // The old position was found, so set it in the record.
        status &= samRecord.set1BasedPosition(*oldPos);

        if(!myKeepTags)
        {
            // Remove the tag.
            status &= samRecord.rmTag(SamTags::ORIG_POS_TAG, SamTags::ORIG_POS_TAG_TYPE);
        }
    }

    return(status);
}
开发者ID:rtchen,项目名称:gotcloud,代码行数:33,代码来源:Revert.cpp


注:本文中的SamRecord::getIntegerTag方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。