本文整理汇总了C++中Obj::getAtomSequence方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ Obj::getAtomSequence方法的具体用法？C++ Obj::getAtomSequence怎么用？C++ Obj::getAtomSequence使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Obj的用法示例。
在下文中一共展示了Obj::getAtomSequence方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: _writeMolecule
void CrfSaver::_writeMolecule (Molecule &molecule)
{
Obj<CmfSaver> saver;
int i;
if (_encoder.get() != 0)
saver.create(_encoder.ref());
else
saver.create(_output);
QS_DEF(Array<int>, atom_flags);
QS_DEF(Array<int>, bond_flags);
if (_atom_stereo_flags != 0)
{
atom_flags.clear_resize(molecule.vertexEnd());
atom_flags.zerofill();
for (i = molecule.vertexBegin(); i != molecule.vertexEnd(); i = molecule.vertexNext(i))
if (_atom_stereo_flags[i] == STEREO_RETAINS)
atom_flags[i] = 1;
else if (_atom_stereo_flags[i] == STEREO_INVERTS)
atom_flags[i] = 2;
saver->atom_flags = atom_flags.ptr();
}
if (_bond_rc_flags != 0)
{
bond_flags.clear_resize(molecule.edgeEnd());
bond_flags.zerofill();
for (i = molecule.edgeBegin(); i != molecule.edgeEnd(); i = molecule.edgeNext(i))
{
if (_bond_rc_flags[i] & RC_UNCHANGED)
bond_flags[i] |= 1;
if (_bond_rc_flags[i] & RC_MADE_OR_BROKEN)
bond_flags[i] |= 2;
if (_bond_rc_flags[i] & RC_ORDER_CHANGED)
bond_flags[i] |= 4;
}
saver->bond_flags = bond_flags.ptr();
}
saver->save_bond_dirs = save_bond_dirs;
saver->save_highlighting = save_highlighting;
saver->save_mapping = save_mapping;
saver->saveMolecule(molecule);
if (_aam != 0)
_writeAam(_aam, saver->getAtomSequence());
if (xyz_output != 0)
{
if (xyz_output == &_output && _encoder.get() != 0)
_encoder->finish();
saver->saveXyz(*xyz_output);
if (xyz_output == &_output && _encoder.get() != 0)
_encoder->start();
}
}