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C++ OBAtom::HasChiralVolume方法代码示例

本文整理汇总了C++中OBAtom::HasChiralVolume方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ OBAtom::HasChiralVolume方法的具体用法?C++ OBAtom::HasChiralVolume怎么用?C++ OBAtom::HasChiralVolume使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在OBAtom的用法示例。


在下文中一共展示了OBAtom::HasChiralVolume方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: GetChirality

  // Seems to make a vector chirality become filled with array of +/- 1 for chiral atoms.
  void GetChirality(OBMol &mol, std::vector<int> &chirality)
  {
    chirality.resize(mol.NumAtoms()+1);
    fill(chirality.begin(),chirality.end(),0);

    OBAtom *atom;
    vector<OBAtom*>::iterator i;
    for (atom = mol.BeginAtom(i);atom;atom = mol.NextAtom(i))
      if (atom->IsChiral())
        {
          if (!atom->HasChiralVolume())
            {
              double sv = CalcSignedVolume(mol,atom);
              if (sv < 0.0)
                {
                  chirality[atom->GetIdx()-1] = -1;
                  atom->SetNegativeStereo();
                }
              else if (sv > 0.0)
                {
                  chirality[atom->GetIdx()-1] = 1;
                  atom->SetPositiveStereo();
                }
            }
          else // already calculated signed volume (e.g., imported from somewhere)
            {
              if (atom ->IsPositiveStereo())
                chirality[atom->GetIdx()-1] = 1;
              else
                chirality[atom->GetIdx()-1] = -1;
            }
        }
  }
开发者ID:candycode,项目名称:openbabel,代码行数:34,代码来源:chiral.cpp


注:本文中的OBAtom::HasChiralVolume方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。