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C++ OBAtom::HasAlphaBetaUnsat方法代码示例

本文整理汇总了C++中OBAtom::HasAlphaBetaUnsat方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ OBAtom::HasAlphaBetaUnsat方法的具体用法?C++ OBAtom::HasAlphaBetaUnsat怎么用?C++ OBAtom::HasAlphaBetaUnsat使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在OBAtom的用法示例。


在下文中一共展示了OBAtom::HasAlphaBetaUnsat方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: if

  int SetMM3Type(OBAtom *atom)
  {
    OBAtom *b; // neighbor
    OBBondIterator i, j;
    int countNeighborO, countNeighborS, countNeighborN, countNeighborC;
    countNeighborO = countNeighborS = countNeighborN = countNeighborC = 0;

    // The MM2 typing isn't very good, so we do this ourselves for the most common atom types
    switch (atom->GetAtomicNum()) {
    case 1: // Hydrogen
      b = atom->BeginNbrAtom(j);
      if (b->IsCarboxylOxygen())
        return 24;
      if (b->GetAtomicNum() == OBElements::Sulfur)
        return 44;
      if (b->GetAtomicNum() == OBElements::Nitrogen) {
        if (b->IsAmideNitrogen())
          return 28;
        if (b->GetValence() > 3)
          return 48;// ammonium
        return 23; // default amine/imine
      }
      if (b->GetAtomicNum() == OBElements::Carbon && b->GetHyb() == 1)
        return 124; // acetylene

      if (b->GetAtomicNum() == OBElements::Oxygen) {
        if (b->HasAlphaBetaUnsat())
          return 73; // includes non-enol/phenol, but has the right spirit
        return 21; // default alcohol
      }

      return 5; // default H
      break;

    case 2: // Helium
      return 51; break;
    case 3: // Li
      return 163; break;

    case 5: // B
      if (atom->GetValence() >= 4)
        return 27; // tetrahedral
      return 26; break;

    case 6: // C
      if (atom->IsInRingSize(3)) { // cyclopropane / cyclopropene
        if (atom->GetHyb() == 3)
          return 22;
        if (atom->GetHyb() == 2) {
          if (atom->CountFreeOxygens() == 1) // propanone
            return 67;
          return 38; // propane
        }
      }
      if (atom->IsInRingSize(4)) { // cyclobutane or cyclobutene
        if (atom->GetHyb() == 3)
          return 56;
        if (atom->GetHyb() == 2) {
          if (atom->CountFreeOxygens() == 1) // butanone
            return 58;
          return 57; // regular cyclobutane
        }
      }

      if (atom->CountBondsOfOrder(2) == 2) { // allene
        if (atom->CountFreeOxygens() == 1) // ketene
          return 106;
        return 68;
      }

      if (atom->GetFormalCharge() == +1)
        return 30;
      if (atom->GetSpinMultiplicity() == 2)
        return 29;

      if (atom->GetHyb() == 3)
        return 1;
      else if (atom->GetHyb() == 2) {
        if (atom->CountFreeOxygens() >= 1)
          return 3;
        return 2;
      }
      else if (atom->GetHyb() == 1)
        return 4;
      break;

    case 7: // N
      // TODO
      if (atom->IsAmideNitrogen())
        return 151;
      if (atom->IsAromatic()) {
        if (atom->GetFormalCharge() == 1)
          return 111;
        if (atom->IsInRingSize(5)) // pyrrole
          return 40;
        if (atom->IsInRingSize(6)) // pyridine
          return 37;
      }

      if (atom->CountFreeOxygens() == 2) // nitro
//.........这里部分代码省略.........
开发者ID:Reinis,项目名称:openbabel,代码行数:101,代码来源:tinkerformat.cpp


注:本文中的OBAtom::HasAlphaBetaUnsat方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。