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C++ Graph::EdgeNucls方法代码示例

本文整理汇总了C++中Graph::EdgeNucls方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Graph::EdgeNucls方法的具体用法?C++ Graph::EdgeNucls怎么用?C++ Graph::EdgeNucls使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Graph的用法示例。


在下文中一共展示了Graph::EdgeNucls方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: MergeSequences

Sequence MergeSequences(const Graph& g,
		const vector<typename Graph::EdgeId>& continuous_path) {
	vector < Sequence > path_sequences;
	path_sequences.push_back(g.EdgeNucls(continuous_path[0]));
	for (size_t i = 1; i < continuous_path.size(); ++i) {
		VERIFY(
				g.EdgeEnd(continuous_path[i - 1])
						== g.EdgeStart(continuous_path[i]));
		path_sequences.push_back(g.EdgeNucls(continuous_path[i]));
	}
	return MergeOverlappingSequences(path_sequences, g.k());
}
开发者ID:fw1121,项目名称:Pandoras-Toolbox-for-Bioinformatics,代码行数:12,代码来源:utils.hpp

示例2: GetSequenceOfPathRegion

Sequence GetSequenceOfPathRegion(Graph &g, size_t k_value, vector<EdgeId> path,
		pair<size_t, size_t> region){
	VERIFY(IsPathRegionCorrect(region, path.size()));

	if(region.first > region.second)
		return Sequence();

	EdgeId cur_edge = path[region.first];
	Sequence seq = g.EdgeNucls(cur_edge);

	for(auto i = region.first + 1; i <= region.second; ++i){
		Sequence next_seq = g.EdgeNucls(path[i]);
		seq = seq + next_seq.Subseq(k_value, next_seq.size());
	}

	return seq;
}
开发者ID:fw1121,项目名称:Pandoras-Toolbox-for-Bioinformatics,代码行数:17,代码来源:path_routines.hpp


注:本文中的Graph::EdgeNucls方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。