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C++ DeBruijnNode::getKmer方法代码示例

本文整理汇总了C++中DeBruijnNode::getKmer方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ DeBruijnNode::getKmer方法的具体用法?C++ DeBruijnNode::getKmer怎么用?C++ DeBruijnNode::getKmer使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在DeBruijnNode的用法示例。


在下文中一共展示了DeBruijnNode::getKmer方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: testTreeConstructionHelper

void AssemblyJobSsDeBruijn::testTreeConstructionHelper(set<ScoredSeq*>* foundKmers, SeqNode* node, int stepsToBottom){
  if (stepsToBottom == 0){
    DeBruijnNode* dbNode = dynamic_cast<DeBruijnNode*>(node);
    foundKmers->insert( new ScoredSeqMonoScore(dbNode->getKmer(), dbNode->getKmerScore()) );
    //foundKmers->insert( ScoredSeq::getScoredSeq(dbNode->getKmer(), dbNode->getKmerScore()) );
  } else {
    char nucList[] = {'A','T','C','G'};
    for (int n = 0; n < 4; ++n){
      SeqNode* nextNode = node->getBranch( nucList[n] );
      if (nextNode != 0){ testTreeConstructionHelper( foundKmers, nextNode, stepsToBottom-1 ); }
    }
  }
}
开发者ID:ccls,项目名称:sequencing,代码行数:13,代码来源:AssemblyJobSsDeBruijn.cpp


注:本文中的DeBruijnNode::getKmer方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。