本文整理汇总了C++中DeBruijnNode::getKmer方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ DeBruijnNode::getKmer方法的具体用法?C++ DeBruijnNode::getKmer怎么用?C++ DeBruijnNode::getKmer使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类DeBruijnNode
的用法示例。
在下文中一共展示了DeBruijnNode::getKmer方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: testTreeConstructionHelper
void AssemblyJobSsDeBruijn::testTreeConstructionHelper(set<ScoredSeq*>* foundKmers, SeqNode* node, int stepsToBottom){
if (stepsToBottom == 0){
DeBruijnNode* dbNode = dynamic_cast<DeBruijnNode*>(node);
foundKmers->insert( new ScoredSeqMonoScore(dbNode->getKmer(), dbNode->getKmerScore()) );
//foundKmers->insert( ScoredSeq::getScoredSeq(dbNode->getKmer(), dbNode->getKmerScore()) );
} else {
char nucList[] = {'A','T','C','G'};
for (int n = 0; n < 4; ++n){
SeqNode* nextNode = node->getBranch( nucList[n] );
if (nextNode != 0){ testTreeConstructionHelper( foundKmers, nextNode, stepsToBottom-1 ); }
}
}
}