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C++ BitSet::addMember方法代码示例

本文整理汇总了C++中BitSet::addMember方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ BitSet::addMember方法的具体用法?C++ BitSet::addMember怎么用?C++ BitSet::addMember使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在BitSet的用法示例。


在下文中一共展示了BitSet::addMember方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: main

int Application::main(int argc,char *argv[])
{
  // Process command line
  cmd=new CommandLine(argc,argv,"");
  if(cmd->numArgs()!=2)
    throw String("\ndelete-target-gaps <in.maf> <target-name>\n");
  String mafFile=cmd->arg(0);
  String targetName=cmd->arg(1);
  
  // Setting up alphabet
  alphabet=&DnaDashDotAlphabet::global();
  gapSymbols.addMember(alphabet->lookup('-'));
  gapSymbols.addMember(alphabet->lookup('.'));
  gapSymbols.addMember(alphabet->lookup('N'));
  alphabetMap=new DropGapMapping(*alphabet,PureDnaAlphabet::global());
  
  // Load the alignments
  //int rootID=phylogeny->getRoot()->getID();
  alignment=NULL;
  ifstream is(mafFile.c_str());
  if(!is.good()) throw String("Can't open file ")+mafFile;
  while(!is.eof()) {
    MultiAlignment *a=new MultiAlignment;
    a->loadMAF(is);
    if(a->getNumTracks()>0) {
      a->toupper();
      MultSeqAlignment *m=new MultSeqAlignment(*a,*alphabet,gapSymbols);
      int rootID=m->getTrackByName(targetName).getID();
      m->deleteTargetGaps(rootID);
      if(!alignment) alignment=m;
      else {
	alignment->append(*m);
	delete m;
      }
    }
    delete a;
  }
  is.close();

  // Emit the processed alignment
  alignment->printSlice(cout,0,alignment->getLength(),'+',60);

  return 0;
}
开发者ID:bmajoros,项目名称:PhyLib,代码行数:44,代码来源:delete-target-gaps.C


注:本文中的BitSet::addMember方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。