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C++ AlignmentConstPtr::getChildNames方法代码示例

本文整理汇总了C++中AlignmentConstPtr::getChildNames方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ AlignmentConstPtr::getChildNames方法的具体用法?C++ AlignmentConstPtr::getChildNames怎么用?C++ AlignmentConstPtr::getChildNames使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在AlignmentConstPtr的用法示例。


在下文中一共展示了AlignmentConstPtr::getChildNames方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: printChildren

void printChildren(ostream& os, AlignmentConstPtr alignment, 
                   const string& genomeName)
{
  vector<string> children = alignment->getChildNames(genomeName);
  for (size_t i = 0; i < children.size(); ++i)
  {
    os << children[i];
    if (i != children.size() - 1)
    {
      os << " ";
    }
  }
  os << endl;
}
开发者ID:dayin1989,项目名称:hal,代码行数:14,代码来源:halStatsMain.cpp

示例2: validateAlignment

void hal::validateAlignment(AlignmentConstPtr alignment)
{
  deque<string> bfQueue;
  bfQueue.push_back(alignment->getRootName());
  while (bfQueue.empty() == false)
  {
    string name = bfQueue.back();
    bfQueue.pop_back();
    if (name.empty() == false)
    {
      const Genome* genome = alignment->openGenome(name);
      if (genome == NULL)
      {
        throw hal_exception("Failure to open genome " + name);
      }
      validateGenome(genome);
      vector<string> childNames = alignment->getChildNames(name);
      for (size_t i = 0; i < childNames.size(); ++i)
      {
        bfQueue.push_front(childNames[i]);
      }
    }
  }
}
开发者ID:BioinformaticsArchive,项目名称:hal,代码行数:24,代码来源:halValidate.cpp


注:本文中的AlignmentConstPtr::getChildNames方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。