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C++ Alignment::global_alignment方法代码示例

本文整理汇总了C++中Alignment::global_alignment方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Alignment::global_alignment方法的具体用法?C++ Alignment::global_alignment怎么用?C++ Alignment::global_alignment使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Alignment的用法示例。


在下文中一共展示了Alignment::global_alignment方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: Alignment

    void test2()
    {
        std::string string_a = "CAGCCCTAC";
        std::string string_b = "CCTGTACCC";

        std::vector<std::vector<int>> similarity = {
                {+2, +0, +0, +0, -1},
                {+0, +2, +0, +0, -1},
                {+0, +0, +2, +0, -1},
                {+0, +0, +0, +2, -1},
                {-1, -1, -1, -1, +2}
        };

        Alignment alignment = Alignment(string_a, string_b, Alignment::STR_WEIGHTS(1, -1, -1), similarity,
                                        [](int j) { return -(1); });

        std::pair<std::string, std::string> result = alignment.global_alignment();


        std::string expected_a = "CAGCCCTAC--";
        std::string expected_b = "C--CTGTACCC";

        if (result.first != expected_a || result.second != expected_b)
        {
            alignment.debugS();
            this->testFailed("Test2");
        }
    }
开发者ID:mmiszy,项目名称:Bioinfa,代码行数:28,代码来源:AlignmentTest.cpp


注:本文中的Alignment::global_alignment方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。