本文整理汇总了C++中Alignment::get_similarity方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Alignment::get_similarity方法的具体用法?C++ Alignment::get_similarity怎么用?C++ Alignment::get_similarity使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Alignment
的用法示例。
在下文中一共展示了Alignment::get_similarity方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: Alignment
void test5()
{
std::string string_a = "GTATT";
std::string string_b = "TTT";
std::vector<std::vector<int>> similarity = {
//A G C T -
{+1, -1, -1, -1, -1},
{-1, +1, -1, -1, -1},
{-1, -1, +1, -1, -1},
{-1, -1, -1, +1, -1},
{-1, -1, -1, -1, +1}
};
Alignment alignment = Alignment(string_a, string_b, Alignment::STR_WEIGHTS(1, -1, -1), similarity,
[](int j) { return -(j+2); });
int result = alignment.get_similarity();
int expected_result = -3;
if (result != expected_result)
{
alignment.debugS();
this->testFailed("Test5");
}
}