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C++ Alignment::get_similarity方法代码示例

本文整理汇总了C++中Alignment::get_similarity方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Alignment::get_similarity方法的具体用法?C++ Alignment::get_similarity怎么用?C++ Alignment::get_similarity使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Alignment的用法示例。


在下文中一共展示了Alignment::get_similarity方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: Alignment

    void test5()
    {
        std::string string_a = "GTATT";
        std::string string_b = "TTT";

        std::vector<std::vector<int>> similarity = {
                //A   G   C   T   -
                {+1, -1, -1, -1, -1},
                {-1, +1, -1, -1, -1},
                {-1, -1, +1, -1, -1},
                {-1, -1, -1, +1, -1},
                {-1, -1, -1, -1, +1}
        };

        Alignment alignment = Alignment(string_a, string_b, Alignment::STR_WEIGHTS(1, -1, -1), similarity,
                                        [](int j) { return -(j+2); });

        int result = alignment.get_similarity();

        int expected_result = -3;
        if (result != expected_result)
        {
            alignment.debugS();
            this->testFailed("Test5");
        }
    }
开发者ID:mmiszy,项目名称:Bioinfa,代码行数:26,代码来源:AlignmentTest.cpp


注:本文中的Alignment::get_similarity方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。