本文整理匯總了Python中puzzle.plugins.VcfPlugin.case_objs方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python VcfPlugin.case_objs方法的具體用法？Python VcfPlugin.case_objs怎麽用？Python VcfPlugin.case_objs使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類puzzle.plugins.VcfPlugin的用法示例。
在下文中一共展示了VcfPlugin.case_objs方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: select_plugin
# 需要導入模塊: from puzzle.plugins import VcfPlugin [as 別名]
# 或者: from puzzle.plugins.VcfPlugin import case_objs [as 別名]
def select_plugin(case_obj):
"""Select and initialize the correct plugin for the case."""
if case_obj.variant_mode == 'vcf':
logger.debug("Using vcf plugin")
plugin = VcfPlugin(root_path=case_obj.variant_source,
vtype=case_obj.variant_type)
plugin.case_objs = [case_obj]
elif case_obj.variant_mode == 'gemini':
logger.debug("Using gemini plugin")
plugin = GeminiPlugin(db=case_obj.variant_source,
vtype=case_obj.variant_type)
case_id = case_obj.case_id
return plugin, case_id