Python TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法代碼示例

本文整理匯總了Python中oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法的具體用法？Python TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap怎麽用？Python TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils的用法示例。

在下文中一共展示了TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法的2個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: _determine_if_cds_overlap

# 需要導入模塊: from oncotator.TranscriptProviderUtils import TranscriptProviderUtils [as 別名]
# 或者: from oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils import test_feature_overlap [as 別名]
 def _determine_if_cds_overlap(self, s, e, tx, variant_type):
     if variant_type == VariantClassification.VT_INS:
         is_cds_overlap = TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap(s, s, tx.get_cds()) != -1
     else:
         is_cds_overlap = TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap(s, e, tx.get_cds()) != -1
     return is_cds_overlap

開發者ID:alexramos，項目名稱:oncotator，代碼行數:8，代碼來源:VariantClassifier.py

示例2: _determine_exon_index

# 需要導入模塊: from oncotator.TranscriptProviderUtils import TranscriptProviderUtils [as 別名]
# 或者: from oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils import test_feature_overlap [as 別名]
 def _determine_exon_index(self, s, e, tx, variant_type):
     if variant_type != VariantClassification.VT_INS:
         return TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap(s, e, tx.get_exons())
     else:
         return TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap(s, s, tx.get_exons())

開發者ID:dhlbh，項目名稱:oncotator，代碼行數:7，代碼來源:VariantClassifier.py

注：本文中的oncotator.TranscriptProviderUtils.TranscriptProviderUtils.test_feature_overlap方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台，相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目，源碼版權歸原作者所有，傳播和使用請參考對應項目的License；未經允許，請勿轉載。