Python Universe.build_topology方法代碼示例

本文整理匯總了Python中MDAnalysis.Universe.build_topology方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python Universe.build_topology方法的具體用法？Python Universe.build_topology怎麽用？Python Universe.build_topology使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類MDAnalysis.Universe的用法示例。

在下文中一共展示了Universe.build_topology方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: test_bonds

# 需要導入模塊: from MDAnalysis import Universe [as 別名]
# 或者: from MDAnalysis.Universe import build_topology [as 別名]
 def test_bonds(self):
     u = Universe(self.filename, guess_bonds=True)
     # need to force topology to load before querying individual atom bonds
     u.build_topology()
     bonds0 = u.select_atoms("segid B and (altloc A)")[0].bonds
     bonds1 = u.select_atoms("segid B and (altloc B)")[0].bonds
     assert_equal(len(bonds0), len(bonds1))

注：本文中的MDAnalysis.Universe.build_topology方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台，相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目，源碼版權歸原作者所有，傳播和使用請參考對應項目的License；未經允許，請勿轉載。