R densCols 平滑密度图的颜色

说明

densCols 生成一个包含颜色的向量，这些颜色对散点图中每个点的局部密度进行编码。

用法

densCols(x, y = NULL, nbin = 128, bandwidth,
         colramp = colorRampPalette(blues9[-(1:3)]))
blues9

参数

x, y	x 和 y 参数提供点的 x 和 y 坐标。定义坐标的任何合理方式都是可以接受的。详细信息请参见函数xy.coords。如果单独提供，它们的长度必须相同。
nbin	长度为 1(对于两个方向)或 2(分别对于 x 和 y)的数值向量，指定用于密度估计的等距网格点的数量；直接用作 bkde2D() 中的 gridsize 。
bandwidth	平滑带宽的数值向量(长度为 1 或 2)。如果缺少，则使用或多或少有用的默认值。 bandwidth 随后传递给函数 bkde2D 。
colramp	函数接受整数 n 作为参数并返回 n 颜色。

细节

densCols 计算并返回将在绘图中使用的颜色集，从包 KernSmooth 调用 bkde2D(*, bandwidth, gridsize = nbin, ..) 。

blues9 是一组 9 种蓝色色调，用作绘图中的默认值。

值

densCols 返回长度为 nrow(x) 的向量，其中包含要在后续散点图中使用的颜色。每种颜色代表相应点周围的局部密度。

例子

x1  <- matrix(rnorm(1e3), ncol = 2)
x2  <- matrix(rnorm(1e3, mean = 3, sd = 1.5), ncol = 2)
x   <- rbind(x1, x2)

dcols <- densCols(x)
graphics::plot(x, col = dcols, pch = 20, main = "n = 1000")

作者

Florian Hahne at FHCRC, originally

也可以看看

bkde2D 来自包 KernSmooth ；此外， smoothScatter() (包 graphics )建立在与 densCols 相同的计算基础上。