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Python TableIO.format_string方法代码示例

本文整理汇总了Python中xplib.TableIO.format_string方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TableIO.format_string方法的具体用法?Python TableIO.format_string怎么用?Python TableIO.format_string使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在xplib.TableIO的用法示例。


在下文中一共展示了TableIO.format_string方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: Main

# 需要导入模块: from xplib import TableIO [as 别名]
# 或者: from xplib.TableIO import format_string [as 别名]
def Main():
    '''
    IO TEMPLATE
    '''
    global args,out
    args=ParseArg()
    if args.output=="stdout":
        out=sys.stdout
    else:
        try:
            out=open(args.output,"w")
        except IOError:
            print >>sys.stderr,"can't open file ",args.output,"to write. Using stdout instead"
            out=sys.stdout
    if args.input=="stdin":
        fin=sys.stdin
    else:
        try:
            x=args.input.split(".")
            if x[-1]=="gz":
                fin=gzip.open(args.input,"r")
            else:
                fin=open(args.input,"r")
        except IOError:
            print >>sys.stderr,"can't read file",args.input
            fin=sys.stdin
    '''
    END OF IO TEMPLATE 
    '''
    print >>out,"# This data was generated by program ",sys.argv[0]," (version: %s)"%VERSION,
    print >>out,"in bam2x ( https://github.com/nimezhu/bam2x )"
    print >>out,"# Date: ",time.asctime()
    print >>out,"# The command line is :"
    print >>out,"#\t"," ".join(sys.argv)
    h1={}
    h2={}

    for i in TableIO.parse(fin):
        h1[i[args.c1-1]]=i
    for j in TableIO.parse(args.input2):
        h2[j[args.c2-1]]=j

        if h1.has_key(j[args.c2-1]):
            print >>out,TableIO.format_string(h1[j[args.c2-1]])+"\t"+TableIO.format_string(j)
开发者ID:purcaro,项目名称:bam2x,代码行数:46,代码来源:xMergeTab.py


注:本文中的xplib.TableIO.format_string方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。