本文整理汇总了Python中xbb_utils.NotePad.text_id方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python NotePad.text_id方法的具体用法？Python NotePad.text_id怎么用？Python NotePad.text_id使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类xbb_utils.NotePad的用法示例。
在下文中一共展示了NotePad.text_id方法的5个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: export
# 需要导入模块: from xbb_utils import NotePad [as 别名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 别名]
def export(self):
"""Export selected text to new text window."""
seq = self.get_selection_or_sequence()
if not seq:
return
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end', seq)示例2: gcframe
# 需要导入模块: from xbb_utils import NotePad [as 别名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 别名]
def gcframe(self, direction='both'):
seq = self.get_selection_or_sequence()
if not seq:
return
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end',
self.translator.gcframe(seq, self.current_codon_table_id,
direction))示例3: extract
# 需要导入模块: from xbb_utils import NotePad [as 别名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 别名]
def extract(self):
seq = self.get_selection_or_sequence()
frame = self.frame_int.get()
if not seq:
return
aa_seq = self.translator.frame(seq, frame, self.current_codon_table_id)
aa_seq = re.sub('(.{50})', '\\1\n', str(aa_seq))
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end', '>frame%d\n%s' % (frame, aa_seq))示例4: translate
# 需要导入模块: from xbb_utils import NotePad [as 别名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 别名]
def translate(self):
seq = self.get_selection_or_sequence()
frame = self.frame_int.get()
if not seq:
return
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end',
self.translator.frame_nice(seq, frame,
self.current_codon_table_id))示例5: statistics
# 需要导入模块: from xbb_utils import NotePad [as 别名]
# 或者: from xbb_utils.NotePad import text_id [as 别名]
def statistics(self):
seq = self.get_selection_or_sequence()
if not seq:
return
seq = seq.upper()
aa = {'A': 0, 'C': 0, 'G': 0, 'T': 0, 'N': 0}
for nt in seq:
if nt not in aa:
nt = 'N'
aa[nt] = aa[nt] + 1
GC = (100.0 * (aa['G'] + aa['C'])) / len(seq)
np = NotePad()
tid = np.text_id()
tid.insert('end', "%s\n\n" %
(time.strftime('%y %b %d, %X\n',
time.localtime(time.time()))) +
"Length = %d\nA=%d C=%d G=%d T=%d other=%d\nGC=%f\n\n" %
(len(seq), aa['A'], aa['C'], aa['G'], aa['T'], aa['N'], GC))