本文整理汇总了Python中vasp.Vasp.copy方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Vasp.copy方法的具体用法？Python Vasp.copy怎么用？Python Vasp.copy使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类vasp.Vasp的用法示例。
在下文中一共展示了Vasp.copy方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: Vasp
# 需要导入模块: from vasp import Vasp [as 别名]
# 或者: from vasp.Vasp import copy [as 别名]
# Run NH3 NEB calculations
from vasp import Vasp
from ase.neb import NEB
from ase.io import read
atoms = Vasp('molecules/nh3-initial').get_atoms()
atoms2 = Vasp('molecules/nh3-final').get_atoms()
# 5 images including endpoints
images = [atoms] # initial state
images += [atoms.copy() for i in range(3)]
images += [atoms2] # final state
neb = NEB(images)
neb.interpolate()
calc = Vasp('molecules/nh3-neb',
xc='PBE',
ibrion=1, encut=350,
nsw=90,
spring=-5.0,
atoms=images)
#calc.write_db(atoms, 'molecules/nh3-neb/00/DB.db')
#calc.write_db(atoms2, 'molecules/nh3-neb/04/DB.db')
images, energies = calc.get_neb()
calc.stop_if(None in energies)
print images
print energies
p = calc.plot_neb(show=False)
import matplotlib.pyplot as plt
plt.savefig('images/nh3-neb.png')