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Python Task.analysis方法代码示例

本文整理汇总了Python中tasks.models.Task.analysis方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Task.analysis方法的具体用法?Python Task.analysis怎么用?Python Task.analysis使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在tasks.models.Task的用法示例。


在下文中一共展示了Task.analysis方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: create_analysis_tasks

# 需要导入模块: from tasks.models import Task [as 别名]
# 或者: from tasks.models.Task import analysis [as 别名]
def create_analysis_tasks(analysis_id):
    print('analysis_id', analysis_id)
    # samples = []
    # print('hello!')
    #create analysis tasks
    # analysis = Analysis.objects.()
    analysis = Analysis.objects.get(pk=analysis_id)
    print(dir(analysis))
    params = analysis.params
    files = params['files']
    for file in files:
        task = Task(user=analysis.user)
        task.manifest = {}
        task.manifest['files'] = [file]
        task.manifest['analysis_types'] = params['analysis_types']
        task.status = 'new'
        task.analysis = analysis
        task.action = 'analysis'
        task.save()
        analysis.tasks.add(task)

    # if 'sample_groups' in  params:
    #     samples = Sample.objects.filter(samplegroup_members__in=params['sample_groups'])
    #     # sample = Sample.objects.first()
    #     # print(dir(sample))
    # for sample in samples:      
    #     print(sample)
    #     for file in sample.files.all():
    #         bam_size = 9223372036854775807
    #         if file.extension == 'bam':
    #             if file.size < bam_size:
    #                 bamfile = file
    #                 bam_size = file.size
    #     print('small bam', bamfile.size)
    # get smallest bam file
开发者ID:raonyguimaraes,项目名称:mendelmd,代码行数:37,代码来源:tasks.py


注:本文中的tasks.models.Task.analysis方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。