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Python GraphLassoCV.get_precision方法代码示例

本文整理汇总了Python中sklearn.covariance.GraphLassoCV.get_precision方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python GraphLassoCV.get_precision方法的具体用法?Python GraphLassoCV.get_precision怎么用?Python GraphLassoCV.get_precision使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在sklearn.covariance.GraphLassoCV的用法示例。


在下文中一共展示了GraphLassoCV.get_precision方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: computePartialCorrelationsCV

# 需要导入模块: from sklearn.covariance import GraphLassoCV [as 别名]
# 或者: from sklearn.covariance.GraphLassoCV import get_precision [as 别名]
def computePartialCorrelationsCV(coupling_data):

    # standardize
    coupling_data -= coupling_data.mean(axis=0)
    coupling_data /= coupling_data.std(axis=0)


    estimator = GraphLassoCV(alphas=10)
    estimator.fit(coupling_data)
    prec = estimator.get_precision()
    reg_alpha = estimator.alpha_


    #### partial correlations: rho_ij = - p_ij/ sqrt(p_ii * p_jj)
    #diagonal of precision matrix
    prec_diag = np.diag(prec)
    partial_correlations = -prec / np.sqrt(np.outer(prec_diag, prec_diag))

    # set lower half to zero
    partial_correlations[np.tril_indices(400)] = 0

    return estimator.get_precision(), partial_correlations, reg_alpha
开发者ID:susannvorberg,项目名称:contact_prediction,代码行数:24,代码来源:plot_inverse_covariance_analysis.py


注:本文中的sklearn.covariance.GraphLassoCV.get_precision方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。