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Python TabularMSA.metadata方法代码示例

本文整理汇总了Python中skbio.TabularMSA.metadata方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TabularMSA.metadata方法的具体用法?Python TabularMSA.metadata怎么用?Python TabularMSA.metadata使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在skbio.TabularMSA的用法示例。


在下文中一共展示了TabularMSA.metadata方法的3个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_metadata_setter

# 需要导入模块: from skbio import TabularMSA [as 别名]
# 或者: from skbio.TabularMSA import metadata [as 别名]
    def test_metadata_setter(self):
        msa = TabularMSA([DNA('A-A'), DNA('A-G')])
        self.assertFalse(msa.has_metadata())

        msa.metadata = {'hello': 'world'}
        self.assertTrue(msa.has_metadata())
        self.assertEqual(msa.metadata, {'hello': 'world'})

        msa.metadata = {}
        self.assertFalse(msa.has_metadata())
开发者ID:hainm,项目名称:scikit-bio,代码行数:12,代码来源:test_tabular_msa.py

示例2: test_metadata_setter_invalid_type

# 需要导入模块: from skbio import TabularMSA [as 别名]
# 或者: from skbio.TabularMSA import metadata [as 别名]
    def test_metadata_setter_invalid_type(self):
        msa = TabularMSA([Protein('PAW')], metadata={123: 456})

        for md in (None, 0, 'a', ('f', 'o', 'o'), np.array([]),
                   pd.DataFrame()):
            with six.assertRaisesRegex(self, TypeError,
                                       'metadata must be a dict'):
                msa.metadata = md
            self.assertEqual(msa.metadata, {123: 456})
开发者ID:hainm,项目名称:scikit-bio,代码行数:11,代码来源:test_tabular_msa.py

示例3: test_metadata_setter_makes_shallow_copy

# 需要导入模块: from skbio import TabularMSA [as 别名]
# 或者: from skbio.TabularMSA import metadata [as 别名]
    def test_metadata_setter_makes_shallow_copy(self):
        msa = TabularMSA([RNA('-.-'), RNA('.-.')])
        md = {'foo': 'bar', 42: []}
        msa.metadata = md

        self.assertEqual(msa.metadata, md)
        self.assertIsNot(msa.metadata, md)

        md['foo'] = 'baz'
        self.assertEqual(msa.metadata, {'foo': 'bar', 42: []})

        md[42].append(True)
        self.assertEqual(msa.metadata, {'foo': 'bar', 42: [True]})
开发者ID:hainm,项目名称:scikit-bio,代码行数:15,代码来源:test_tabular_msa.py


注:本文中的skbio.TabularMSA.metadata方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。